Arteri pudenda interna bercabang dari arteri iliaka interna dan mengalirkan darah beroksigen ke genitalia eksterna baik pria maupun wanita. Namun, karena jenis kelamin, ada beberapa perbedaan anatomi.
Arteri cenderung lebih kecil pada wanita. Juga, beberapa cabang arteri dikhususkan untuk jenis kelamin. Pada laki-laki, cabang arteri ini termasuk arteri dorsal dan dalam penis, sedangkan perempuan memiliki arteri dorsal dan dalam pada klitoris. Wanita memiliki cabang labial posterior, sedangkan pria memiliki cabang skrotum. Ada juga pembuluh lain dari arteri ini yang khusus untuk alat kelamin.
Arteri rektal inferior dan perineum yang bercabang dari arteri pudenda interna sama pada kedua jenis kelamin.